生物除臭塔一般2級配合使用，第一級加濕，第二級加生物填料進行處理有機惡臭廢氣，惡臭廢氣經過管道收集裝置將惡臭氣體送到廢氣系統的增濕洗滌裝置，廢氣系統增濕循環裝置采用高壓霧化噴嘴，將水充分霧化后與氣流混合，迅速使待處理的氣體濕度達到飽和狀態，為生物過濾工序的穩定運行創造了良好的條件。經增濕處理后的廢氣經氣體分布器由下而上進入生物過濾器裝置，利用附著在反應器內填料上的微生物，在新陳代謝過程中將廢氣中的污染物降解為簡單的無機物和微生物細胞質，水溶液中的惡臭成分被微生物吸附、吸收，惡臭成分從水中轉移至微生物體內，進入微生物細胞的惡臭成分作為營養物質為微生物所分解、利用，從而實現除臭達標排放。
生物除臭過濾凈化系統的核心為高效復合生物濾塔或濾池、有利于生物附著和生長附著填料及高效復合微生物菌種，使復合生物濾塔或濾池中的微生物在適宜的環境條件下，在有機生物填料表面形成生物膜，生物膜中的微生物利用廢氣中的無機和有機物作為碳源和能源，通過降解惡臭物質維持其生命活動，并將惡臭物質分解為水、二氧化碳和礦物質等無臭物。
生物除臭技術除臭效率高、處理徹底、操作簡便、無二次污染、運行費用低等優勢。
由于廢氣需要和生物菌有足夠的接觸時間，因此設備會很大。風量大于1W風量時應選用生物除臭濾池設備進行處理，效果更理性。
生物除臭塔的工藝流程惡臭氣體經過管道收集后進入預處理裝置，經水洗加濕使廢氣的濕度增加，濕氣體再進入生物除臭塔，使惡臭氣體物質的轉化持續進行，經凈化后的氣體由引風機引出排放。