反滲透設備在使用過程中，除了性能的正常衰減外，由于污染而引起設備性能的衰減更為嚴重。通常的污染主要有化學垢，有機物及膠體污染，微生物污染等。不同的污染表現出的癥狀是不同的。不同的膜公司所提出的膜污染的癥狀也是有一定的差異。
在工程中我們發現，污染時間的長短不一樣，其癥狀也不一樣。如：膜發生碳酸鈣垢污染，污染時間為一個星期時，主要表現為脫鹽率的迅速下降，壓差緩慢增大，而產水量變化不明顯，用檸檬酸清洗能完全恢復性能。污染時間為一年(某純水機)，鹽通量由最初的2mg/L上升為37mg/L(原水為140mg/L～160mg/L)，產水量由230L/h下降為50L/h，用檸檬酸清洗后，鹽通量降為7mg/L，產水量上升至210L/h。
再者污染往往不是單一的，其表現的癥狀也有一定的差別，使得污染的鑒別更困難。
鑒別污染類型要綜合原水水質，設計參數，污染指數，運行記錄，設備性能變化及微生物指標等加以判斷：
(1)膠體污染：發生膠體污染時，通常伴隨著以下兩個特性：A、前處理中微濾器堵塞得很快，尤其是壓差增大很快，B、SDI值通常在2.5以上。
(2)微生物污染：發生微生物污染時，RO設備的透過水和濃縮水中的細菌總數都比較高，平時一定沒有按要求進行保養和消毒。
(3)鈣垢：可依據原水水質及設計參數進行判斷。對碳酸鹽型水而言，如果回收率為75%時，設計時投加了阻垢劑，濃縮液的LSI應小于1；不投加阻垢劑時濃縮液的LSI應小于零，一般不會產生鈣垢。
(4)可用1/4英寸的PVC塑料管插入組件中測試組件不同部位的性能變化進行判斷。
(5)根據設備性能的變化判斷污染的類型。
(6)可用酸洗(如檸檬酸、稀HNO3)，根據清洗的效果和清洗液判斷鈣垢，通過清洗液成分分析進一步證實。
(7)對清洗液進行化學分析：取原水、清洗原液、清洗液，三個樣分析。
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